Finalrunde
Hin
Rück
Elfer
| Kilkenny FC
| (12,5)
| vs
| Celtic FC
| (12,3)
| 3 : 1 | 2 : 6 |
| Eintracht Frankfurt
| (13,0)
| vs
| Feyenoord Rotterdam
| (12,2)
| 7 : 2 | 2 : 6 |
| AEK Athen
| (13,4)
| vs
| FC Wacker Innsbruck
| (12,3)
| 6 : 1 | 2 : 6 |
| Cracovia Kraków
| (13,0)
| vs
| SC Bastia
| (12,8)
| 6 : 2 | 2 : 7 |
| Odd Grenland
| (12,4)
| vs
| Celta Vigo
| (12,1)
| 5 : 0 | 2 : 7 |
| FC Viktoria Pilsen
| (12,6)
| vs
| SV Ried
| (12,1)
| 3 : 4 | 5 : 3 |
| Samsunspor
| (12,2)
| vs
| Eintracht Braunschweig
| (12,4)
| 3 : 2 | 1 : 6 |
| Vikingur Reykjavik
| (12,0)
| vs
| Tottenham Hotspur FC
| (12,1)
| 6 : 3 | 3 : 6 | 4:5 n.E. |
| SC Cambuur-Leeuwarden
| (12,0)
| vs
| Strømsgodset IF
| (13,0)
| 6 : 1 | 2 : 7 |
| Willem II Tilburg
| (12,0)
| vs
| Jeunesse Esch
| (12,4)
| 3 : 1 | 1 : 5 |
| SC Heerenveen
| (12,0)
| vs
| Kickers Offenbach
| (12,4)
| 6 : 1 | 2 : 5 |
| Bangor City FC
| (12,8)
| vs
| FC Schalke 04
| (12,7)
| 7 : 2 | 2 : 7 | 4:3 n.E. |
| Mjallby AIF
| (12,0)
| vs
| CS Marítimo
| (12,1)
| 7 : 1 | 1 : 6 |
| AS Nancy-Lorraine
| (8,1)
| vs
| Caernarfon Town FC
| (12,7)
| 0 : 2 | 0 : 7 |
| FC Parma
| (12,1)
| vs
| Asteras Tripolis
| (12,3)
| 4 : 2 | 2 : 4 | 5:4 n.E. |
| Manchester United FC
| (13,1)
| vs
| Dundee United
| (12,3)
| 5 : 2 | 1 : 7 |
|
Achtelfinale
Hin
Rück
Elfer
| Caernarfon Town FC
| (5,1)
| vs
| SC Bastia
| (5,6)
| 3 : 1 | 1 : 4 |
| SC Cambuur-Leeuwarden
| (5,2)
| vs
| Mjallby AIF
| (5,4)
| 4 : 1 | 1 : 2 |
| AEK Athen
| (7,0)
| vs
| Odd Grenland
| (6,4)
| 3 : 2 | 2 : 3 | 3:2 n.E. |
| FC Parma
| (6,9)
| vs
| Jeunesse Esch
| (7,4)
| 4 : 0 | 2 : 7 |
| SC Heerenveen
| (5,2)
| vs
| Eintracht Frankfurt
| (5,8)
| 6 : 2 | 0 : 3 |
| Eintracht Braunschweig
| (6,0)
| vs
| Tottenham Hotspur FC
| (4,3)
| 6 : 1 | 0 : 4 |
| FC Viktoria Pilsen
| (5,2)
| vs
| Dundee United
| (0,7)
| 3 : 0 | 1 : 0 |
| Bangor City FC
| (5,6)
| vs
| Celtic FC
| (6,5)
| 6 : 2 | 0 : 3 |
|
Viertelfinale
Hin
Rück
Elfer
| SC Cambuur-Leeuwarden
| (1,0)
| vs
| Eintracht Braunschweig
| (1,6)
| 1 : 0 | 0 : 2 |
| AEK Athen
| (3,0)
| vs
| SC Heerenveen
| (0,4)
| 1 : 0 | 0 : 0 |
| FC Viktoria Pilsen
| (1,8)
| vs
| Bangor City FC
| (0,8)
| 1 : 0 | 0 : 1 | 3:4 n.E. |
| SC Bastia
| (1,8)
| vs
| Jeunesse Esch
| (1,8)
| 1 : 1 | 1 : 1 | 3:4 n.E. |
|
Halbfinale
Hin
Rück
Elfer
| AEK Athen
| (2,6)
| vs
| Jeunesse Esch
| (0,0)
| 0 : 0 | 1 : 0 |
| Bangor City FC
| (0,4)
| vs
| Eintracht Braunschweig
| (0,0)
| 0 : 0 | 0 : 0 | 4:3 n.E. |
|
Finale
Spiel
| Elfer
| Bangor City FC
| (0,8)
| vs
| AEK Athen
| (2,0)
| 0 : 2 |
|
| Legende: n.E. Spiel nach Elfmeterschiessen entschieden
Erstgenanntes Team = Hinspiel zu Hause
Erstgenannte Torzahl = Heimmannschaft des Hinspiels
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